La Protéodie: La mélodie des protéines:
On pourrait dialoguer musicalement avec une protéine.….
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> Peut-on identifier des extraits de mélodies des protéines dans des musiques ?
Si des extraits de protéodies peuvent correspondre à des extraits de mélodies, pouvons nous mettre en rapport les fonctions biologiques des protéines ciblées et le contexte de la création de la mélodie, un événement dans la vie du compositeur, les paroles de la chanson ?
C’est une recherche assez complexe, car :
> il faut déterminer si l’extrait de mélodie peut faire partie d’une protéodie
> Il faut trouver les protéines ciblées par cette protéodie, dans une base de données de protéines
> Il faut parcourir la littérature scientifique pour essayer de comprendre les fonctions biologiques des protéines ciblées;
> Il faut demander à un biologiste de confirmer ces fonctions biologiques
> Il faut faire des recherche pour comprendre le contexte de création de la mélodie par le compositeur
> Il faut analyser les paroles de la chanson
Et enfin on peut voir si les fonctions biologiques des protéines ciblées sont en rapport avec les recherches contextuelles sur la mélodie étudiée.Mais c’est une recherche passionnante, car:
> elle permet d’aider à faire connaitre le système de la protéodie
> elle permet d’enrichir les connaissances du biologiste en matière d’homologie entre protéines, pour comprendre les relations entre ces différentes protéines et faire apparaître une “cartographie biologique” plus grande, grâce aux homologies musicales.
> elle permet de comprendre un des aspects de la création musicale, qui pourrait être liée à l’activité de certaines protéines en fonction d’un contexte particulier.
La création d’une mélodie peut-elle être liée à un besoin biologique ?
1) Extraits de Protéodies dans “Walking on the moon” (Police)
Le début de la mélodie du chant de “Walking on the moon” contient 2 extraits de protéodies. L’une d’elle stimule l’activité d’une protéine impliquée dans la création de nouveaux gènes
a) Une protéodie qui stimule (STIM) l’activité de la protéine: Q9H5L6|THAP9_HUMAN DNA transposase
b) une protéodie qui inhibe (INH) l’activité de la protéine: Q9Y236|OSGI2_HUMAN Oxidative stress-induced growth inhibitor 2a) Q9H5L6|THAP9_HUMAN DNA transposase THAP9
(position 617) KMLRQVLVTSSSPTC….. (Pour vérifier, cliquer sur ce lien, pour voir dans la base de donnée uniprot et rechercher cette suite de lettres en jaune, dans la page cible de ce lien)
La suite de notes “La4 La4 Sol4 Do5 La4 Fa4 Sol4 Fa4 Fa4 Mi4 Mi4” se trouve dans une seule protéine humaine sur plusieurs milliers possibles: HUMAN DNA transposase THAP9.
La protéodie qui contient cette suite de notes stimule l’activité de cette protéine.
Un des processus biologiques de cette protéine est la la transposition de l’ADN. C’est un élément transposable. (voir Biological Process “transposition DNA-mediated” dans cette page: https://www.uniprot.org/uniprotkb/Q9H5L6/entry.
et l’explication dans celle-ci: https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/term/GO:0006313)
Plusieurs expériences penchent en faveur d’un rôle prédominant de ces éléments transposables dans l’évolution des espèces, par la création de nouveaux gènes. Ils seraient aussi une source d’amortissement des mutations dues à l’environnement.
https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89l%C3%A9ment_transposable#Chez_l’humainb) Q9Y236 OSGI2_HUMAN Oxidative stress-induced growth inhibitor 2
(position 110) KLEQHHYIPHV….(Pour vérifier, cliquer sur ce lien, pour voir dans la base de donnée uniprot et rechercher cette suite de lettres en bleu dans la page cible de ce lien)
La suite de notes “Fa4 Sol4 Fa4 Fa4 Mi4 Mi4 Ré4″ se trouve dans 3 protéines humaines sur plusieurs milliers possibles, dont:
HUMAN Oxidative stress-induced growth inhibitor 2.
La protéodie qui contient cette suite de notes inhibe l’activité de cette protéine.
Une des maladie associée au gène de cette protéine est le ” Nijmegen Breakage Syndrome”
https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=OSGIN2
qui est syndrome d’instabilité chromosomique génétique rare.
https://www.orpha.net/consor/cgi-bin/OC_Exp.php?Expert=647&lng=ENc) Essai d’analyse
il est troublant de constater ici, qu’une des mélodies qui a révolutionné la pop internationale et qui l’a faite évoluée en créant un nouveau style, contient un extrait de la protéodie qui stimule une protéine impliquée dans l’évolution des espèces, par la création de nouveaux gènes et qui inhibe une autre protéine homologue impliquée dans l’instabilité chromosomique génétique.
Ces deux protéines sont “musicalement homologues”
Nous pouvons remarquer que des fonctions culturelles et biologiques semblent correspondre: La création d’un nouveau style musical et la création de nouveaux gènes2) Extraits de Protéodies dans “Entre dos Aguas” (Paco de Lucia)
Dans le système musical de la protéodie, ce ne sont pas les notes qui sont importantes mais les intervalles entre ces notes. Ainsi une mélodie peut être transposée dans une autre gamme en gardant les même intervalles. On peut par exemple jouer une chanson qui est en Sol majeur, dans la tonalité de Do Majeur. Les intervalles de la gamme sont conservés.
Ainsi on peut transposer une mélodie dans les gammes de la protéodie, pour rechercher si des protéines sont reliées à cette mélodie initiale.Le début du thème de guitare de “Entre dos aguas” se trouvent dans une protéodie qui stimule 2 protéines homologues:
a) ADCY6_HUMAN Adenylate cyclase type 6
b) Q9NVH2 INT7_HUMAN Integrator complex subunit 7a) ADCY6_HUMAN Adenylate cyclase type 6
….(position 142) RYFFQMNQSSLT…. (Pour vérifier, cliquer sur ce lien, pour voir dans la base de donnée Uniprot et rechercher cette suite de lettres en jaune, dans la page cible de ce lien)https://www.uniprot.org/uniprotkb/O43306/entry
Cette protéine est impliquée dans le processus du système circulatoire et rénal. Elle permet la régulation de l’urine, la réabsorption de l’eau et son homéostasie (phénomène par lequel un facteur clé est maintenu autour d’une valeur bénéfique pour le système considéré, grâce à un processus de régulation).
https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/term/GO:0003091b) Q9NVH2 INT7_HUMAN Integrator complex subunit 7
…(position 793) RYFFQKLQSTSI…(Pour vérifier, cliquer sur ce lien, pour voir dans la base de donnée uniprot et rechercher cette suite de lettres en jaune, dans la page cible de ce lien)
https://www.uniprot.org/uniprotkb/Q9NVH2/entry
Cette protéine est impliquée dans le processus de réparation de l’ADN
Ce processus biologique comprend des points de contrôle des dommages à l’ADN.
Il permet notamment une réponse cellulaire d’un organisme, face aux
rayonnements ionisants tels que les rayons gamma qui proviennent d’éléments radioactifs et qui provoquent des dommages directs à l’ADN et des dommages indirects par radiolyse de l’eau. Ces dommages sont soit éliminés, soit fixés dans la cellule sous la forme d’une mutation ou d’un réarrangement chromosomique par des processus de réparation de l’ADN.
https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/term/GO:0071479C) Essai d’analyse
Le morceau “Entre dos Aguas” contient l’extrait d’une protéodie qui stimule 2 protéines homologues:
> une protéine impliquée dans la réabsorption et l’homéostasie (optimisation) de l’eau, par la régulation de l’urine.
Le morceau s’appelle “Entre dos Aguas” et une des protéines ciblées est impliquée dans la réabsorption de l’eau
> une protéine impliquée dans la réparation des dommages de l’ADN créés par des rayons radioactifs ou créés par radiolyse de l’eau.
Ce morceau est sorti en 1973. C’est aussi l’année où l’Espagne s’est lancée dans un ambitieux programme de construction de centrales nucléaires, suite à la mise en service entre 1968 et 1972 de ses 3 premières centrales nucléaires.
https://augustinmassin.blogspot.com/2020/11/espagne-l-histoire-avortee-du-programme.html3) Extraits de Protéodies dans Musique de transe Gnawa
4) Extraits de Protéodies dans musique de transe: Tarentelle
5) Extraits de Protéodies dans les mélodies d’un merle
6) Extraits de Protéodies dans la mélodie d’un rossignol ?
7) Extraits de Protéodies dans la mélodie d’une lavande ?